Protein–RNA interactions for Protein: B9A030

TISP43, Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TISP43B9A030 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TISP43B9A030 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TISP43B9A030 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TISP43B9A030 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms