Protein–RNA interactions for Protein: B4E1Z4

cDNA FLJ55673, highly similar to Complement factor B (EC 3.4.21.47), humanhuman

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4E1Z4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
B4E1Z4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
B4E1Z4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
B4E1Z4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
B4E1Z4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
B4E1Z4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
B4E1Z4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
B4E1Z4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
B4E1Z4 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
B4E1Z4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
B4E1Z4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
B4E1Z4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
B4E1Z4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
B4E1Z4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
B4E1Z4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
B4E1Z4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
B4E1Z4 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
B4E1Z4 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
B4E1Z4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
B4E1Z4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
B4E1Z4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
B4E1Z4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
B4E1Z4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
B4E1Z4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
B4E1Z4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
B4E1Z4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
B4E1Z4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
B4E1Z4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
B4E1Z4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
B4E1Z4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
B4E1Z4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
B4E1Z4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
B4E1Z4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
B4E1Z4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
B4E1Z4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
B4E1Z4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
B4E1Z4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
B4E1Z4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
B4E1Z4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
B4E1Z4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
B4E1Z4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
B4E1Z4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
B4E1Z4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
B4E1Z4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
B4E1Z4 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
B4E1Z4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
B4E1Z4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
B4E1Z4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
B4E1Z4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
B4E1Z4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
B4E1Z4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
B4E1Z4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
B4E1Z4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
B4E1Z4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
B4E1Z4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
B4E1Z4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
B4E1Z4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
B4E1Z4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
B4E1Z4 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
B4E1Z4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
B4E1Z4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
B4E1Z4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
B4E1Z4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
B4E1Z4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
B4E1Z4 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
B4E1Z4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
B4E1Z4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
B4E1Z4 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
B4E1Z4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
B4E1Z4 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
B4E1Z4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
B4E1Z4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
B4E1Z4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
B4E1Z4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
B4E1Z4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
B4E1Z4 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
B4E1Z4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
B4E1Z4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
B4E1Z4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
B4E1Z4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
B4E1Z4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
B4E1Z4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
B4E1Z4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
B4E1Z4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
B4E1Z4 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
B4E1Z4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
B4E1Z4 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
B4E1Z4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
B4E1Z4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
B4E1Z4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
B4E1Z4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
B4E1Z4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
B4E1Z4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
B4E1Z4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
B4E1Z4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
B4E1Z4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
B4E1Z4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
B4E1Z4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
B4E1Z4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
B4E1Z4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms