Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PALM2-AKAP2B1ALY0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PALM2-AKAP2B1ALY0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms