Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
KNCNA6PVL3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KNCNA6PVL3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms