Protein–RNA interactions for Protein: A6NE82

MBD3L3, Putative methyl-CpG-binding domain protein 3-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L3A6NE82 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MBD3L3A6NE82 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MBD3L3A6NE82 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms