Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GOLGA6BA6NDN3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GOLGA6BA6NDN3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GOLGA6BA6NDN3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms