Protein–RNA interactions for Protein: A4D1F6

LRRD1, Leucine-rich repeat and death domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRD1A4D1F6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
LRRD1A4D1F6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
LRRD1A4D1F6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms