Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ7

PRAMEF27, PRAME family member 27, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF27A3QJZ7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PRAMEF27A3QJZ7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
PRAMEF27A3QJZ7 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PRAMEF27A3QJZ7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms