Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
FRMD3A2A2Y4 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
FRMD3A2A2Y4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms