Protein–RNA interactions for Protein: A0PJW6

TMEM223, Transmembrane protein 223, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM223A0PJW6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM223A0PJW6 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM223A0PJW6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms