Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
E2F8A0AVK6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
E2F8A0AVK6 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
E2F8A0AVK6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms