Protein–RNA interactions for Protein: A0A087X1B8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A087X1B8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
A0A087X1B8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
A0A087X1B8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms