Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 RNF216-202ENST00000389902 3293 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 MAP3K21-202ENST00000366623 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
DKK2Q9UBU2 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms