Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 AC004893.2-203ENST00000482799 796 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL440P-201ENST00000577855 343 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 AC018845.3-201ENST00000562536 516 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 SPATA21-202ENST00000375577 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 AC011676.3-201ENST00000520606 294 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 TIMMDC1-207ENST00000493694 710 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 SNHG4-204ENST00000507197 865 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 CHTF8-207ENST00000520529 475 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 PMF1-203ENST00000368279 1019 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 CHEK2-203ENST00000382565 696 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 AC005722.1-201ENST00000431878 964 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 IL1F10-201ENST00000341010 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 AC026412.1-206ENST00000502273 206 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 LINC01444-201ENST00000580867 764 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
CCDC180Q9P1Z9 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms