Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

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Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
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VAPAQ9P0L0 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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VAPAQ9P0L0 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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VAPAQ9P0L0 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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VAPAQ9P0L0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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VAPAQ9P0L0 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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VAPAQ9P0L0 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
VAPAQ9P0L0 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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