Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 MED14-201ENST00000324817 7984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms