Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CLSPNQ9HAW4 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms