Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 RGS22-201ENST00000360863 4296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
RSG1Q9BU20 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 MBP-205ENST00000397860 4844 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RSG1Q9BU20 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms