Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms