Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AL627422.1-201ENST00000434104 580 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
COG3Q96JB2 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms