Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 MICB-202ENST00000399150 2346 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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RNF185Q96GF1 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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RNF185Q96GF1 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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RNF185Q96GF1 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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RNF185Q96GF1 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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RNF185Q96GF1 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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RNF185Q96GF1 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
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RNF185Q96GF1 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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RNF185Q96GF1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
RNF185Q96GF1 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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