Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SGF29Q96ES7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms