Protein–RNA interactions for Protein: Q969F2

NKD2, Protein naked cuticle homolog 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD2Q969F2 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NKD2Q969F2 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms