Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI2

CNKSR2, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR2Q8WXI2 GLS-203ENST00000409215 632 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC090579.1-201ENST00000518591 504 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC091820.1-201ENST00000523497 648 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 ZNF546-204ENST00000596894 714 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC097382.1-201ENST00000441093 591 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 ZDHHC20P3-201ENST00000531576 336 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AL121790.2-201ENST00000553425 379 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 OR4C3-202ENST00000611380 597 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC010480.1-201ENST00000624823 684 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AL122008.3-201ENST00000412483 1723 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AC005736.1-201ENST00000576810 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CNKSR2Q8WXI2 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms