Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC82Q8N4S0 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC82Q8N4S0 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC82Q8N4S0 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC82Q8N4S0 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC82Q8N4S0 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC82Q8N4S0 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC82Q8N4S0 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC82Q8N4S0 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC82Q8N4S0 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC82Q8N4S0 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC82Q8N4S0 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC82Q8N4S0 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC82Q8N4S0 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC82Q8N4S0 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC82Q8N4S0 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC82Q8N4S0 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC82Q8N4S0 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC82Q8N4S0 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC82Q8N4S0 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC82Q8N4S0 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC82Q8N4S0 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms