Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLIP4Q8N3C7 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AL118506.1-201ENST00000601296 3082 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CLIP4Q8N3C7 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CLIP4Q8N3C7 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CLIP4Q8N3C7 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CLIP4Q8N3C7 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 STRA6-203ENST00000416286 2750 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CLIP4Q8N3C7 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CLIP4Q8N3C7 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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CLIP4Q8N3C7 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CLIP4Q8N3C7 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
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CLIP4Q8N3C7 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CLIP4Q8N3C7 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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