Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RUFY3Q7L099 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RUFY3Q7L099 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms