Protein–RNA interactions for Protein: Q6XPS3

TPTE2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase TPTE2, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTE2Q6XPS3 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TPTE2Q6XPS3 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms