Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CENPPQ6IPU0 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CENPPQ6IPU0 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms