Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT98

PRAMEF20, PRAME family member 20, humanhuman

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Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20Q5VT98 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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PRAMEF20Q5VT98 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PRAMEF20Q5VT98 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PRAMEF20Q5VT98 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PRAMEF20Q5VT98 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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PRAMEF20Q5VT98 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
PRAMEF20Q5VT98 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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