Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ALFQ53S48 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms