Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 MCM5-202ENST00000382011 2402 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ARMC1-202ENST00000458464 2849 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AC004672.2-201ENST00000537181 574 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 RN7SL279P-201ENST00000582185 284 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 GAPDHP72-202ENST00000636791 2141 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
ANKRD39Q53RE8 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PDE6B-212ENST00000496514 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 RAP1GAP2-203ENST00000540393 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 BCL2L11-221ENST00000621302 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 BCL2L11-222ENST00000622509 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ALPL-203ENST00000374832 2193 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 YTHDF2-208ENST00000541996 2719 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 EHF-202ENST00000450654 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 OR10G3-202ENST00000641040 2533 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 CARS-AS1-201ENST00000499962 2664 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PALLD-209ENST00000507735 4379 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 NUB1-212ENST00000568733 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 TBC1D3B-202ENST00000611257 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ZNF862-201ENST00000223210 6950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AC108058.1-201ENST00000457290 2044 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 MTA2-202ENST00000524902 2577 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 BRAP-202ENST00000419234 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 NLRP2-201ENST00000263437 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
ANKRD39Q53RE8 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms