Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 PRKAR2A-AS1-203ENST00000431705 592 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
C4orf17Q53FE4 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms