Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
TTLL9Q3SXZ7 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms