Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HADHQ16836 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HADHQ16836 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHQ16836 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHQ16836 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHQ16836 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHQ16836 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHQ16836 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHQ16836 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHQ16836 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHQ16836 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHQ16836 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHQ16836 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHQ16836 PRELP-201ENST00000343110 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHQ16836 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHQ16836 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHQ16836 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHQ16836 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHQ16836 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHQ16836 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHQ16836 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHQ16836 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHQ16836 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHQ16836 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHQ16836 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHQ16836 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHQ16836 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HADHQ16836 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms