Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 HDAC7-203ENST00000380610 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 GTF2F1-201ENST00000394456 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 RAB37-202ENST00000392610 2858 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 DHX30-215ENST00000619982 3574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 GFRA2-202ENST00000517328 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 INTS3-204ENST00000435409 3597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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CTF1Q16619 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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CTF1Q16619 ELP4-203ENST00000395934 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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CTF1Q16619 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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CTF1Q16619 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 TMC5-204ENST00000541464 3581 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 IL10-202ENST00000423557 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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CTF1Q16619 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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CTF1Q16619 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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CTF1Q16619 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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CTF1Q16619 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 LINC01679-201ENST00000442815 2798 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 TRPV1-209ENST00000576351 2525 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 NPTN-IT1-201ENST00000628401 2283 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 USP17L7-201ENST00000530447 2022 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 KLF7-204ENST00000423015 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 ZNF774-201ENST00000354377 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CTF1Q16619 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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