Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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SSX1Q16384 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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SSX1Q16384 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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SSX1Q16384 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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SSX1Q16384 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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SSX1Q16384 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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SSX1Q16384 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SSX1Q16384 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
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