Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms