Protein–RNA interactions for Protein: Q15052

ARHGEF6, Rho guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF6Q15052 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 TEX33-201ENST00000381821 978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 OR7E115P-201ENST00000382617 1024 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 PFN2-212ENST00000490975 858 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 ORAOV1-205ENST00000535657 709 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 SLC50A1-203ENST00000368404 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 TPM1-220ENST00000559556 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARHGEF6Q15052 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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