Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TCIRG1Q13488 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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