Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AC093503.1-201ENST00000593888 495 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 SIX3-AS1-201ENST00000419364 844 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AC093609.1-201ENST00000434020 952 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AC111149.2-202ENST00000518355 599 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SMAD4Q13485 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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