Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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PTP4A2Q12974 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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PTP4A2Q12974 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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PTP4A2Q12974 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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PTP4A2Q12974 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTP4A2Q12974 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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