Protein–RNA interactions for Protein: Q12874

SF3A3, Splicing factor 3A subunit 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A3Q12874 MTUS1-226ENST00000524044 567 ntTSL 47.12□□□□□ -1.272e-13■□□□□ 10.4
SF3A3Q12874 MTUS1-221ENST00000522149 543 ntTSL 45.09□□□□□ -1.592e-13■□□□□ 10.4
SF3A3Q12874 MTUS1-227ENST00000524371 564 ntTSL 44.48□□□□□ -1.692e-13■□□□□ 10.4
SF3A3Q12874 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.393e-6■□□□□ 10.4
SF3A3Q12874 AKAP1-208ENST00000572557 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.293e-6■□□□□ 10.4
SF3A3Q12874 AKAP1-219ENST00000621116 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.383e-6■□□□□ 10.4
SF3A3Q12874 AKAP1-206ENST00000571629 3105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.383e-6■□□□□ 10.4
SF3A3Q12874 AKAP1-212ENST00000573326 1580 ntTSL 511.84□□□□□ -0.513e-6■□□□□ 10.4
SF3A3Q12874 AKAP1-204ENST00000539273 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.613e-6■□□□□ 10.4
SF3A3Q12874 AKAP1-203ENST00000481416 4089 ntTSL 511.24□□□□□ -0.613e-6■□□□□ 10.4
SF3A3Q12874 HSP90B1-209ENST00000552051 581 ntTSL 27.48□□□□□ -1.218e-28■□□□□ 10.4
SF3A3Q12874 PKD1P6-203ENST00000538100 705 ntTSL 318.39■□□□□ 0.536e-8■□□□□ 10.4
SF3A3Q12874 GGA2-207ENST00000566651 332 ntTSL 37.72□□□□□ -1.176e-6■□□□□ 10.4
SF3A3Q12874 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.414e-27■□□□□ 10.4
SF3A3Q12874 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.314e-27■□□□□ 10.4
SF3A3Q12874 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.264e-27■□□□□ 10.4
SF3A3Q12874 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.154e-27■□□□□ 10.4
SF3A3Q12874 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.154e-27■□□□□ 10.4
SF3A3Q12874 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.124e-27■□□□□ 10.4
SF3A3Q12874 C6orf48-202ENST00000375635 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.474e-27■□□□□ 10.4
SF3A3Q12874 C6orf48-209ENST00000395789 952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.474e-27■□□□□ 10.4
SF3A3Q12874 C6orf48-201ENST00000375633 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.244e-27■□□□□ 10.4
SF3A3Q12874 SRSF11-213ENST00000481648 389 ntTSL 39.86□□□□□ -0.831e-23■□□□□ 10.4
SF3A3Q12874 SRSF11-214ENST00000484162 4008 ntTSL 1 (best)7.34□□□□□ -1.231e-23■□□□□ 10.4
SF3A3Q12874 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.51e-23■□□□□ 10.4
SF3A3Q12874 RBM3-206ENST00000485213 947 ntTSL 216.39■□□□□ 0.212e-28■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 CFB-278ENST00000472581 1059 ntTSL 214.46□□□□□ -0.091e-14■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 RBM3-205ENST00000472897 501 ntTSL 514.42□□□□□ -0.12e-28■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 RBM3-207ENST00000488216 835 ntTSL 313.08□□□□□ -0.322e-28■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 RBM3-209ENST00000490127 567 ntTSL 59.98□□□□□ -0.812e-28■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 CFB-279ENST00000475617 586 ntTSL 47.29□□□□□ -1.241e-14■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.614e-15■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.154e-15■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.551e-6■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 RPS16-203ENST00000595386 1035 ntTSL 214.41□□□□□ -0.12e-13■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.412e-13■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 RPS16-206ENST00000601390 2389 ntTSL 211.47□□□□□ -0.572e-13■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 RPS16-201ENST00000251453 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.772e-13■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 RPS16-205ENST00000599705 407 ntTSL 39.05□□□□□ -0.962e-13■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 RPS16-204ENST00000599539 555 ntTSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.012e-13■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 RPS16-207ENST00000601655 492 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.052e-13■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.168e-7■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 DUSP6-203ENST00000547140 604 ntTSL 314.3□□□□□ -0.128e-7■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 DUSP6-201ENST00000279488 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.618e-7■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 NOP58-203ENST00000433543 714 ntTSL 35.27□□□□□ -1.571e-36■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC2.46□□□□□ -2.021e-36■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 SLC39A5-210ENST00000481103 926 ntTSL 212.93□□□□□ -0.343e-19■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 RNF31-206ENST00000558452 575 ntTSL 311.92□□□□□ -0.51e-10■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 CCAR1-205ENST00000483264 487 ntTSL 55.61□□□□□ -1.512e-11■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 CCAR1-203ENST00000479143 478 ntTSL 54.78□□□□□ -1.642e-11■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.093e-7■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 PRPF40A-212ENST00000545856 1358 ntTSL 1 (best)15.11■□□□□ 0.012e-7■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 PRPF40A-201ENST00000354363 1622 ntTSL 212.24□□□□□ -0.452e-7■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 PRPF40A-211ENST00000493468 1043 ntTSL 1 (best)11.23□□□□□ -0.612e-7■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 NOTUM-204ENST00000489218 972 ntTSL 216.98■□□□□ 0.319e-12■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 IGDCC3-203ENST00000559058 564 ntTSL 520.6■□□□□ 0.892e-7■□□□□ 10.3
SF3A3Q12874 TCF25-212ENST00000564652 860 ntTSL 316.86■□□□□ 0.292e-6■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 TCF25-214ENST00000565196 655 ntTSL 512.81□□□□□ -0.362e-6■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 RERE-213ENST00000480342 2710 ntTSL 210.93□□□□□ -0.662e-9■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 RERE-211ENST00000469251 355 ntTSL 33.06□□□□□ -1.922e-9■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 RERE-218ENST00000514428 273 ntTSL 32.3□□□□□ -2.042e-9■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 CHD8-209ENST00000555935 2617 ntTSL 58.4□□□□□ -1.078e-7■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 SAT2-214ENST00000576846 1563 nt23.52■■□□□ 1.364e-6■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 SAT2-202ENST00000380466 974 ntTSL 1 (best)13.56□□□□□ -0.244e-6■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 SAT2-206ENST00000571195 814 ntTSL 212.3□□□□□ -0.444e-6■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 SAT2-213ENST00000576686 582 ntTSL 212.08□□□□□ -0.484e-6■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 SAT2-205ENST00000571074 860 ntTSL 210.97□□□□□ -0.654e-6■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 SAT2-207ENST00000572224 669 ntTSL 310.97□□□□□ -0.654e-6■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 SAT2-211ENST00000575826 838 ntTSL 310.28□□□□□ -0.764e-6■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 SAT2-208ENST00000573566 640 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.794e-6■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 SAT2-201ENST00000269298 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.73□□□□□ -1.014e-6■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 SAT2-212ENST00000576579 535 ntTSL 37.94□□□□□ -1.144e-6■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 SAT2-203ENST00000570850 685 ntTSL 37.12□□□□□ -1.274e-6■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 FMO5-204ENST00000478432 1606 ntTSL 28.51□□□□□ -1.054e-18■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 TNS3-203ENST00000415929 570 ntTSL 411.21□□□□□ -0.615e-7■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.375e-7■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 TCF25-206ENST00000562193 627 ntTSL 38.89□□□□□ -0.994e-18■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 CP-203ENST00000460674 2269 ntTSL 1 (best)7.24□□□□□ -1.253e-19■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 CP-209ENST00000479771 1150 ntTSL 53.84□□□□□ -1.793e-19■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 CP-205ENST00000463556 590 ntTSL 23.27□□□□□ -1.893e-19■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 HNRNPH1-231ENST00000519033 832 ntTSL 315.38■□□□□ 0.058e-39■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 HNRNPH1-240ENST00000521720 539 ntTSL 314.64□□□□□ -0.078e-39■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 HNRNPH1-246ENST00000523449 793 ntTSL 310.79□□□□□ -0.688e-39■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 SLC38A2-207ENST00000548870 576 ntTSL 24.46□□□□□ -1.73e-19■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 ENTPD6-212ENST00000439162 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 320.48■□□□□ 0.873e-6■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 ENTPD6-207ENST00000425813 945 ntTSL 516.39■□□□□ 0.213e-6■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 RSRC2-204ENST00000433877 1956 ntTSL 214.12□□□□□ -0.151e-9■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 RSRC2-212ENST00000527399 1041 ntTSL 512.71□□□□□ -0.371e-9■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 RSRC2-213ENST00000527461 711 ntTSL 311.5□□□□□ -0.571e-9■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 RSRC2-220ENST00000532695 2001 ntTSL 211.38□□□□□ -0.591e-9■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 RSRC2-202ENST00000344591 936 ntTSL 211.35□□□□□ -0.591e-9■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 RSRC2-214ENST00000527796 3156 ntTSL 511.25□□□□□ -0.611e-9■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 RSRC2-210ENST00000526560 545 ntTSL 410.49□□□□□ -0.731e-9■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 RSRC2-207ENST00000525335 1146 ntTSL 510.23□□□□□ -0.771e-9■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 RSRC2-201ENST00000331738 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.41□□□□□ -0.91e-9■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 RSRC2-215ENST00000528263 792 ntTSL 36.52□□□□□ -1.371e-9■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 RSRC2-211ENST00000527173 2570 ntTSL 25.38□□□□□ -1.551e-9■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 RSRC2-218ENST00000531639 522 ntTSL 24.54□□□□□ -1.681e-9■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 STRN3-207ENST00000555358 2208 ntTSL 1 (best)25.19■■□□□ 1.623e-6■□□□□ 10.2
SF3A3Q12874 NT5C3B-207ENST00000470690 1729 ntTSL 524.65■■□□□ 1.543e-6■□□□□ 10.2
Retrieved 100 of 27,864 protein–RNA pairs in 162.9 ms