Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 MSRB3-202ENST00000355192 4289 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 TMCC2-201ENST00000329800 2818 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ZDHHC8-203ENST00000405930 3112 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 TOLLIP-202ENST00000317204 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RAB40BQ12829 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms