Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
AP1B1Q10567 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms