Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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LTBQ06643 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LTBQ06643 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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LTBQ06643 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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LTBQ06643 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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LTBQ06643 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTBQ06643 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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LTBQ06643 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
LTBQ06643 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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LTBQ06643 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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LTBQ06643 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
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