Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 TNPO2-218ENST00000592287 2914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms