Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CYB5R2-201ENST00000299498 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 Metazoa_SRP.156-201ENST00000622344 262 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 SLC35F2-201ENST00000375682 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC107464.2-201ENST00000502923 569 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AC011247.2-201ENST00000457097 233 ntTSL 4 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ANAPC11-214ENST00000578544 403 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ZNF724-202ENST00000597037 780 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
CENPEQ02224 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms