Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 MT1E-202ENST00000330439 729 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 RPL14-203ENST00000416518 812 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SPTBN1Q01082 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70 ms