Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDC42EP1Q00587 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms